Вычислительный кластер «СКИФ Cyberia»

Суперкомпьютер «СКИФ Cyberia» состоит из 640 узлов на базе 1 280 шестиядерных и двухъядерных процессоров Intel® Xeon® серий 5150 и 5670.

Пиковая производительность вычислительного комплекса Томского государственного университета составляет 106.82 Тфлопс, что позволяет проводить ресурсоемкие исследования в различных областях науки.
Система разработана и поставлена компанией Т-Платформы.

Имеется возможность разделения системы на независимые, изолированные друг от друга вычислительные разделы.
Включены средства защиты от несанкционированного доступа, аппаратные средства мониторинга и управления системой.

Технические характеристики

Тип системы/Производитель Кластер/Т-Платформы (Россия)
Процессорная архитектура x86 с поддержкой 64 разрядных расширений
Количество вычислительных
узлов/процессоров/тип процессора/RAM на узел
282 узла/564 двухядерных процессора Intel Xeon 5150, 2,66ГГц (Woodcrest)/8Gb RAM
190 узлов/360 шестиядерных процессоров IntelXeon 5670, 2,93ГГц (Westmere)/24Gb (T-Blade 1.1)RAM
40 узлов/80 шестиядерных процессоров IntelXeon 5670, 2,93ГГц (Westmere)/48Gb RAM (T-Blade 1.1)
128 узлов/256 шестиядерных процессоров IntelXeon 5670, 2,93ГГц (Westmere)/24Gb RAM (T-Blade 2)
20 узлов/40 28-ядерных процессоров Intel Xeon E5-2695V3 и 256 Гб ОЗУ
5 узлов/10 28-ядерных процессоров Intel Xeon E5-2695V3 и 256 Гб ОЗУ, 10 ускорителей Tesla K80
Скорость передачи сообщений между узлами Mellanox Infiniband QDR 40 Гб/сек с задержкой не более 2,5 мкс
Пиковая производительность 106.82 Тфлопс
Реальная производительность на тесте Linpack 78.29 Тфлопс
Суммарный объем оперативной памяти 11,808 Тб
Внешняя дисковая система хранения данных 360 Тб
Потребляемая мощность 300 кВт


На кластере установлено лицензионное программное обеспечение

  • Операционные системы GNU/Linux Community ENTerprise Operating System (CentOS) 6 и Microsoft Windows HPC Server 2008
  • Средства разработки высокопроизводительных приложений – компиляторы GNU, Intel, Portland group (PGI), PathScale EKOPath C/C++/F77/F90, средства отладки Intel, Portland group (PGI), TotalView
  • Поддержка стандартов параллельного программирования MPI и OpenMP
  • Математические библиотеки для проведения параллельных вычислений Intel MKL, IMSL, ScaLapack, PETSc, FFTW
  • Вычисления на кластере с использованием программного обеспечения Matlab (до 128 потоков)
  • Специализированное программное обеспечение ANSYS AUTODYN, ANSYS Multiphysics, ANSYS CFD, CFX, FlowVision, OpenFOAM, ParaView, Salome, NetGen, Open CASCADE
  • Пакеты для расчета молекулярной динамики: MolPro, Gaussian, GAMESS, FireFly, Orca, PSI3, Dalton
  • Моделирующие системы для исследований погоды и климата MM5 и WRF, системы для решения задач охраны окружающей среды CAMx и CMAQ

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ СУПЕРКОМПЬЮТЕРА

Наука, промышленность, производство

  • Разведка нефти и газа
  • Предсказание погоды, климата и глобальных изменений в атмосфере
  • Прогнозирование в финансовой и экономической областях
  • Инженерные расчеты
  • Оптимизация транспортных потоков
  • Управление и логистика на крупных и средних предприятиях
  • Гидро- и газодинамика
  • Разработка фармацевтических препаратов
  • Построение полупроводниковых приборов
  • Генетика человека
  • Астрофизика, небесная динамика
  • Обработка больших баз данных

Стратегические области

  • Управляемый термоядерный синтез, расчет реакторов, расчет поведения плазмы
  • Космические разработки и исследования и многое другое, где можно использовать методы математического моделирования